《果宝特攻3》讲述了 菠萝吹雪 偶然间穿越到了 古代 的水果世界。古代水果尚未经过培植改良，都是野果， 菠萝吹雪 从他们身上学习到中华兵法及古代书画，立志成为为民除害的 英雄 。 菠萝吹雪 开始修复时光机的 旅程 ，竟然遇到了水果伙伴们的 祖先 ，最后帮助他们打败了 火龙果 ，并顺利回到 现代 。
当游戏宅男穿越异界，御姐猫耳娘，萝莉狐耳娘，软妹兔耳娘……这不是动物园！这是一个弱肉强食却又奇妙的异世界！一场真实的策略性游戏，一个巨大的阴谋危机，异界霸主正在加载！
生肖龙、生肖猪和生肖狗大闹蟠桃宴会，不小心将九龙夜光杯打碎，夜光杯上九条小龙化为九颗龙珠，坠落凡间。玉皇大帝派生肖龙等三人去凡间寻找龙珠，将功赎罪。于是，生肖龙等三人踏上了寻找九颗龙珠的漫漫征途。他们经历了九段冒险之旅，最终取得成功。
